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2019年 宏基因组分析和诊断技术在急危重症感染应用的专家共识

摘要

感染是急危重症患者死亡的主要原因之一。近年来，随着新发病原微生物的出现、耐药病原微生物的增多以及免疫抑制宿主的增加，感染的发病率和死亡率仍居高不下，脓毒症（严重感染）患者病死率高达50%。最新调查研究发现，中国脓毒症相关性标化死亡率为66.7例/10万人口，全国每年共有脓毒症相关性死亡病例近103万例。重症感染起病急、进展快、病原体复杂，短时间内能否明确致病病原微生物至关重要。

原文

宏基因组分析和诊断技术在急危重症感染应用专家共识组. 宏基因组分析和诊断技术在急危重症感染应用的专家共识[J]. 中华急诊医学杂志,2019,28(2)：151-155.

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2020年 高通量宏基因组测序技术检测病原微生物的临床应用规范化专家共识

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2020年 宏基因组测序技术在中国重症感染中的临床应用专家共识（第一版）

基于宏基因组学测序（mNGS）的病原学诊断技术是一种非靶向的广谱病原学筛查技术，近几年越来越多的研究表明其在重症感染领域，特别是疑难、罕见病导致的重症感染中发挥了关键性作用。由于mNGS高昂的成本及较高的实验条件要求，目前尚未纳入常规临床检验中。可以预见，随着测序成本的下降及我国医疗水平的不断提高，基于mNGS的病原学诊断技术在临床大规模开展的条件已经逐步成熟。本文从检测、规则和应用等方面阐述了基于mNGS技术在临床中重症感染患者病原学诊断中应用的专家共识，并对其未来在临床应用改进方面提出了展望。

原文

宏基因组学测序技术在中重症感染中的临床应用共识专家组,中国研究型医院学会脓毒症与休克专业委员会,中国微生物学会微生物毒素专业委员会,等. 宏基因组学测序技术在中国重症感染中的临床应用专家共识（第一版）[J]. 中华危重病急救医学,2020,32(05)：531-536.

2020年 中国宏基因组学第二代测序技术检测感染病原体的临床应用专家共识

摘要

病原学的精准诊断对感染性疾病的诊断非常重要。宏基因组学第二代测序技术检测具有无偏倚性、广覆盖、快速等优点，能覆盖更广范围的病原体。本专家共识就第二代测序技术的临床应用范围、样本采集、分析解读和诊断效能等方面进行证据总结和意见推荐，建立中国感染病原体宏基因组学检测的标准规范。

2021年 宏基因组测序病原微生物检测生物信息分析规范化管家专家共识

摘要

2021年 宏基因组高通量测序技术应用于感染性疾病病原检测中国专家共识

2021年 中枢神经系统感染性疾病的脑脊液宏基因组学第二代测序应用专家共识

摘要

宏基因组学第二代测序能够非靶向地检测临床标本中的病原体核酸，在中枢神经系统感染性疾病的病原体诊断方面，已逐步应用于临床。为推进脑脊液宏基因组学第二代测序的合理应用，中华医学会神经病学分会感染性疾病与脑脊液细胞学学组基于国内外研究成果与专家经验，组织撰写了该共识。

原文

中华医学会神经病学分会感染性疾病与脑脊液细胞学学组. 中枢神经系统感染性疾病的脑脊液宏基因组学第二代测序应用专家共识[J]. 中华神经科杂志,2021,54(12)：1234-1240.

2022年 宏基因组二代测序技术在新生儿感染性疾病中的临床应用专家共识

摘要

近年来基于高通量测序平台的宏基因组二代测序（mNGS）技术在新生儿感染性疾病领域得到了广泛应用。为了更加规范mNGS技术在新生儿重症监护病房的应用，中华医学会儿科学分会新生儿学组和中华儿科杂志编辑委员会组织专家以国内外循证医学证据和最新进展为基础，从mNGS技术的临床适应证、标本采集与转运、报告解读等方面给出建议。

原文

中华医学会儿科学分会新生儿学组,中华儿科杂志编辑委员会. 宏基因组二代测序技术在新生儿感染性疾病中的临床应用专家共识[J]. 中华儿科杂志,2022,60(06)：516-521.

2022年 呼吸系统感染中宏基因组测序技术临床应用与结果解读专家共识

2023年 成人呼吸道感染病原诊断核酸检测技术临床应用专家共识

摘要

呼吸道感染性疾病在临床中极为常见，病原体的快速检测和精准诊断是其有效治疗的前提。传统微生物学及免疫学技术对呼吸道病原体检测的灵敏度偏低，核酸检测技术的发展和临床应用大幅提高了呼吸道病原体的诊断能力。如何基于患者基础疾病、呼吸道感染类型及病原谱合理选择核酸检测技术并正确理解其临床应用价值，成为重要的临床问题。为此，中华检验医学培训工程专家委员会联合中华医学会呼吸病学分会组织我国多学科专家共同撰写了《成人呼吸道感染病原诊断核酸检测技术临床应用专家共识(2023)》。该共识参考国内外指南及文献，分析了实时荧光聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR)技术、等温扩增技术、数字PCR技术、核酸即时检测技术和病原体高通量测序技术的临床应用场景、技术特点和性能验证要求，以及该类技术在成人急性上呼吸道感染、气管支气管炎、社区获得性肺炎、医院获得性肺炎/呼吸机相关性肺炎、慢性阻塞性肺疾病急性加重、肺结核和免疫功能受损人群呼吸道感染中的应用，以供临床参考借鉴。

2023年 非人类免疫缺陷病毒相关隐球菌性脑膜炎诊断的中国专家共识

原文

中华医学会神经病学分会神经感染性疾病与脑脊液细胞学学组. 非人类免疫缺陷病毒相关隐球菌性脑膜炎诊断的中国专家共识[J]. 中华神经科杂志,2023,56(10)：1093-1102.

2023年 宏基因组二代测序技术在血液病患者感染病原诊断中的应用中国专家共识

摘要

血液病患者因原发病和（或）治疗相关原因等，免疫功能低下，感染是其常见的并发症[1,2]。血液病患者感染相关临床症状和体征常不典型，感染病原谱广，传统微生物学检测阳性率低、耗时长。因此，病原诊断是优化抗感染治疗、改善患者预后的关键环节。病原宏基因组二代测序（mNGS）是一项覆盖病原谱广且高通量的检测技术，已在临床感染领域得到了广泛的应用。在血液病患者感染病原诊断方面，mNGS检测具有阳性率高、受到抗菌药物干扰小、覆盖病原广的优势。然而，目前尚无mNGS在血液病感染病原诊断中应用的指南或专家共识。为优化血液病患者病原mNGS检测适应证及规范报告解读，在参考血液病领域感染诊治及病原mNGS相关指南等的基础上，中华医学会血液学分会抗感染学组特邀请血液学、病原mNGS检测等领域专家共同制定此专家共识。

原文

中华医学会血液学分会抗感染学组. 宏基因组二代测序技术在血液病患者感染病原诊断中的应用中国专家共识（2023年版）[J]. 中华血液学杂志,2023,44(08)：617-623.

2023年 下呼吸道感染宏基因组二代测序报告临床解读路径专家共识

原文

中华医学会呼吸病学分会. 下呼吸道感染宏基因组二代测序报告临床解读路径专家共识[J]. 中华结核和呼吸杂志,2023,46(04)：322-335.