二代测序技术在骨髓增生异常肿瘤中的临床应用中国专家共识(2026年版) | 指南共识

摘要 骨髓增生异常肿瘤(MDS)是一组高度异质性髓系肿瘤,以血细胞减少、发育不良和高白血病转化风险为特征。二代测序(NGS)技术可高效检测基因突变,已被纳入MDS的诊断分型、预后评估及治疗决策体系。为进一步规范NGS技术在MDS临床实践中的应用,中华医学会血液学分会白血病淋巴瘤学组在整合MDS最新诊治进展、国内外相关指南/共识及国内专家建议的基础上,制定了本版专家共识,以推动NGS在我国MDS诊疗…

摘要
骨髓增生异常肿瘤(MDS)是一组高度异质性髓系肿瘤,以血细胞减少、发育不良和高白血病转化风险为特征。二代测序(NGS)技术可高效检测基因突变,已被纳入MDS的诊断分型、预后评估及治疗决策体系。为进一步规范NGS技术在MDS临床实践中的应用,中华医学会血液学分会白血病淋巴瘤学组在整合MDS最新诊治进展、国内外相关指南/共识及国内专家建议的基础上,制定了本版专家共识,以推动NGS在我国MDS诊疗中的合理应用。
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骨髓增生异常肿瘤(myelodysplastic neoplasms,MDS),此前称骨髓增生异常综合征(myelodysplastic syndromes,MDS),是一组起源于造血干细胞和(或)祖细胞的高度异质性髓系肿瘤,表现为持续性的一系或多系血细胞减少、骨髓细胞发育异常和高风险向AML转化。NGS技术具有高灵敏度和特异性,能一次对数十万条以上DNA序列片段进行测序分析,识别基因变异信息。基因突变作为克隆性造血的证据,被国内外指南推荐作为疑似MDS患者诊断的必检项目,同时也已引入MDS的诊断分型和预后危险度评估。基因突变作为MDS治疗后MRD的监测也已有诸多报道。中西方MDS患者基因突变谱略有不同,国内MDS患者常见突变包括U2AF1、ASXL1、SF3B1、RUNX1、TET2和TP53等。结合最新WHO和临床咨询委员会(CAC)对MDS、潜能未定克隆性造血(CHIP)和意义未明克隆性血细胞减少(CCUS)的诊断标准、NCCN指南、ELN指南、最新临床研究报道及国内的专家共识等对NGS检测在MDS中的应用推荐,形成了此专家共识,以指导临床规范应用。NGS在MDS临床实践中的应用
推荐意见1:基于MDS的WHO 2022和国际共识分类(ICC)标准,NGS检测应作为MDS分型的关键依据。
(一)NGS在MDS诊断分型中的应用1. 可以诊断特定的MDS亚型:MDS伴TP53双等位失活亚型:伴遗传学异常的MDS诊断优先级比伴形态学异常的MDS更高,其中MDS伴双等位TP53失活(MDS-biTP53)为具有最高诊断优先级的亚型,应予优先识别。WHO 2022标准为:①有2个或2个以上不同的TP53突变位点;②至少1个TP53突变位点合并涉及染色体17p13.1缺失;③至少1个TP53突变位点合并涉及染色体17p13.1拷贝中性杂合性缺失;④TP53突变的VAF大于49%。ICC的评估标准有一定差异,TP53突变的MDS患者在按照不同标准分型时,可能出现诊断不一致的情况,建议优先采用ICC标准进行分型(表1)。MDS伴SF3B1突变:WHO诊断分型标准为合并SF3B1突变且骨髓原始细胞比例<5%的MDS患者,无论骨髓是否存在环形铁粒幼细胞,均诊断为MDS伴SF3B1突变,但需除外染色体del(5q)、-7/del(7q)和复杂核型异常。同时WHO标准也认为,MDS患者无SF3B1突变但骨髓RS比例≥15%亦可诊断为MDS-SF3B1。而ICC标准则要求必须有SF3B1突变且VAF≥10%(表1)。MDS-SF3B1相对低危,但可能受其他合并基因如RUNX1、EZH2等突变的影响,可呈现更高危的临床表型,更高的白血病转化风险和更短的OS期。
表1 WHO和ICC标准MDS伴SF3B1突变和MDS伴TP53突变亚型的诊断要求对比MDS的分子分型:近期,Bernard等基于基因组分析确定了DDX41、AML-like、TP53-CK等18个具有不同临床表现和预后的MDS分子亚型,其中一些分子亚型是目前已认定的,如TP53-CK、del(5q)、SF3B1。(二)NGS在MDS治疗决策中的应用推荐意见2:在拟定MDS治疗方案前评估基因突变状态,特别是SF3B1、TP53、IDH1/2、TET2等,以指导药物选择和疗效预判。罗特西普已获FDA批准用于治疗红细胞输注依赖的低危MDS-RS成人患者。SF3B1突变阳性的MDS患者对罗特西普治疗反应率更高,对于低危MDS伴SF3B1突变,尤其是MDS-RS患者,可考虑优先使用罗特西普治疗。建议在MDS-del(5q)患者接受来那度胺治疗前评估TP53突变状态。对于合并TP53突变者,应谨慎使用来那度胺,并加强治疗随访与复发监测。IDH1抑制剂艾伏尼布在复发/难治性MDS患者中展现出显著疗效,FDA批准用于治疗IDH1突变的复发/难治性MDS。推荐IDH1突变且VAF>5%的复发/难治性MDS患者使用艾伏尼布治疗。(三)NGS技术在MDS预后判断中的应用推荐意见3:推荐在MDS初诊评估时使用包含基因突变的国际预后积分系统(Molecular IPSS,IPSS-M),以实现精准预后分层。2022年发布的IPSS-M预后积分系统是目前国际上最系统的MDS分子风险模型。IPSS-M基于连续风险指数,综合评估以下因素:血液学参数、骨髓原始细胞比例、细胞遗传学风险分组、16个主要预后相关突变基因(ASXL1、CBL、DNMT3A、ETV6、EZH2、FLT3、IDH2、KRAS、MLLPTD、NPM1、NRAS、RUNX1、SF3B1、SRSF2、multi-hit TP53和U2AF1),以及15个次要突变基因(BCOR、BCORL1、CEBPA、ETNK1、GATA2、GNB1、IDH1、NF1、PHF6、PPM1D、PRPF8、PTPN11、SETBP1、STAG2和WT1)中突变基因的数量。可在线(https://mdsrisk-model.com/)进行个性化评分,预测患者预后,IPSS-M预测效力优于IPSS-R。(四)NGS技术在MDS克隆演变监测中的应用推荐意见4:可将NGS用于MDS患者的动态随访,监测基因突变谱变化,以识别克隆演变、疾病进展及疗效监测。1. MDS患者克隆演变的分子特征与监测重点:(1)信号通路相关的基因突变(NRAS、KRAS、CBL、NF1、PTPN11、FLT3、KIT、IDH1、IDH2)与细胞增殖相关,常新发于进展为AML的过程中,需密切监测,早期预测MDS白血病转化风险。(2)TP53突变的患者,在向AML转化的过程中则更常出现TP53克隆扩增、VAF升高,而非新发的基因突变,应重点监测TP53 VAF变化。(3)DDX41胚系突变的MDS患者建议将克隆负荷及造血功能变化作为监测重点。2. NGS监测治疗相关的克隆演变:NGS技术可通过超高深度测序检测到低至0.01%的肿瘤细胞残留,为传统疗效评价标准提供分子层面的补充信息。治疗后若观察到关键突变克隆(如TP53、RUNX1、SRSF2、DDX41等)清除,提示疗效较好。经治疗完全缓解的患者也可仍然存在较大的克隆(如DNMT3A、TET2),提示仍存在克隆性造血状态。此外,治疗过程中出现新突变(如RUNX1、TET2、CBL、DDX41、PPM1D和TP53等)往往提示复发风险升高、缓解深度不足。3. NGS在接受HSCT患者中的指导作用:NGS可在移植前识别携带不良预后相关突变的患者,如TP53突变和信号通路基因(NRAS、KRAS、CBL、NF1、RIT1、PTPN11、FLT3、KIT)突变。如检测到DDX41、CEBPA、RUNX1、GATA2等胚系致病变异,应进行家系验证评估供者适配性并进行遗传咨询。还有助于早期识别分子复发,而分子学复发和血液学复发之间约间隔71d,是进行抢先治疗的最佳窗口期。4. NGS监测时点:建议在初诊、充分治疗后疗效判断、治疗过程中出现疗效丧失、HSCT前评估、移植后每3~6个月以及疾病进展时进行NGS检测,以调整治疗策略、监测疾病进展和评估预后。对于较低危MDS患者,在随访过程中建议每年至少进行1次NGS检测。(五)NGS用于遗传易感MDS的筛查推荐意见5:对以下人群进行肿瘤易感基因筛查:①所有≤50岁的患者,携带DDX41胚系突变的患者常>50岁;②低增生性MDS;③新诊断的MDS合并其他肿瘤;④携带胚系突变患者,其亲缘造血干细胞供者;⑤任何年龄的临床疑似遗传易感性综合征,早发性或多重癌症、对化疗或放疗表现出过度毒性、干细胞动员不良、不明原因的血细胞减少或大红细胞增多症、肺纤维化或肝纤维化、合并先天免疫缺陷、实验室检查结果提示免疫缺陷或免疫失调。(一)样本采集与处理
通常采集骨髓液,EDTA抗凝管采集2~3ml,采集后尽快检测。骨髓干抽无法获取足够骨髓液的患者可采集外周血,建议采用Streck管采集10ml,可常温保存3~7d。(二)样本检测要点NGS靶向测序策略主要有2种,基于杂交捕获和基于扩增子的靶向测序。两种测序策略各有优劣,临床医师应根据具体的基因检测组合大小、基因数量和时效性选择。(三)基因检测组合选择关于基因检测组合的选择,应由临床专家和实验室专家共同决定,相关依据参考ELN、NCCN、WHO 2022、ICC指南对MDS、CHIP、CCUS及胚系易感倾向髓系肿瘤的诊断标准,IPSS-M预后积分系统包含基因组套以及中华医学会等机构指南或共识。建议检测的体细胞突变和易感的胚系突变基因见表2。筛查突变类型应包括SNV、Indel、FLT3-ITD和KMT2A-PTD。检测区域应考虑临床诊疗指南、专家共识、权威数据库及实验室自建数据库。具体指导原则如下:①有明确基因突变热点区域,应优先纳入,如TET2、DNMT3A、SF3B1、SRSF2、U2AF1;②无明确基因突变热点区域,应纳入全部外显子,如TP53、EZH2、ASXL1、RUNX1、BCOR、NF1;③影响蛋白功能的剪切位点区域,应纳入剪切位点至少±5bp范围;④非翻译区突变基因,应纳入相应区域,如ANKRD26、GATA2。
表2 骨髓增生异常肿瘤相关突变基因列表(四)NGS检测报告和结果解读
基因检测报告解读的呈现应由临床专家和实验室专家共同制定,突变位点的临床意义解读应简明清晰、明确易懂。检测报告应明确患者基本信息、样本信息、实验室测序平台与测序策略、测序深度、突变基因检测内容、质控信息,并明确VAF的LOD,建议报告VAF LOD≥2%。报告首页应汇总所有检测阳性信息。突变位点的检测结果应纳入突变基因、染色体定位、转录本号、外显子、核苷酸改变、氨基酸改变、突变频率及CNV等条目信息,位点临床意义的解读应参考国内外MDS诊疗指南、权威数据库(如COSMIC、ClinVar、HGMD、TCGA)和重要文献,并附上来源。
关于突变位点的分级,参照《二代测序技术在血液肿瘤中的应用中国专家共识(2018年版)》将变异等级分为三类:一级变异,具有明确临床意义的突变;二级变异,具有潜在临床意义的突变;三级变异,临床意义未明的突变。
结语
随着对MDS认知的不断加深、NGS成本的降低,合理与规范地应用NGS检测将为MDS的诊断及鉴别诊断、分型、预后分层及治疗提供重要依据。未来需要开展更多的研究,进一步探索MDS分子生物学异常的价值。临床实践中,应组建分子肿瘤专家委员会,纳入临床医师、病理科医师、检验科医师、分子生物学专家与生物信息学专家等多专业领域专家,进行多学科合作。通过对患者临床诊疗信息、基因检测结果与治疗方案的整合实现患者的全病程管理,提升患者临床获益。
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参考文献
中华医学会血液学分会白血病淋巴瘤学组. 二代测序技术在骨髓增生异常肿瘤中的临床应用中国专家共识(2026年版)[J]. 中华血液学杂志,2026,47(01):6-13.


